Fizyoterapi ve Rehabilitasyon Bölümü program amaçları aşağıda belirtilmiştir:
- Sağlıklı, hasta ve engelli bireylerin sağlık problemlerine duyarlı, mesleki etik ve sorumluluk bilincine sahip,
- Multidisipliner çalışma becerisini kazanmış,
- Araştırmacı ve klinisyen kimliğiyle kendini yenileyen, güncel değerlendirme ve tedavi stratejilerini takip eden,
- Güncel literatürü ve klinik uygulamaları takip ederek kanıta dayalı fizyoterapi uygulamalarını klinik karar verme sürecinde kullanabilen,
- Hareket korunması ve geliştirilmesi amacıyla en uygun fizyoterapi değerlendirmesini yapan,
- Hareket ve fonksiyon bozukluklarında tüm populasyonlarda, bireye özgü tedavi stratejilerini, programı geliştiren ve uygulayan,
- Fonksiyonel bağımsızlık ve performansın korunması ve geliştirilmesini sağlayan,
- Aktivite limitasyonlarının azaltılması ve yaşam kalitesinin iyileştirilmesi yönünde bireye özgü gereksinimleri belirleyerek, fizyoterapi ve rehabilitasyon uygulamalarını yapan,
- Hasta ve sağlıklı bireyin genel iyilik halinin sağlanmasında rehabilitasyon bilgilerini en iyi şekilde kullanabilen ve uygulayan,
- Birey, aile ve toplum sağlığını geliştirmede fiziksel, sosyal ve psikolojik perspektiften fizyoterapi ve rehabilitasyon yöntemlerinin her alanına özgü bilgi, uygulama becerisi ve yeteneğine sahip fizyoterapistler yetiştirmektir.
Muş Alparslan Üniversitesi 
